是指mRNA 翻译成氨基酸序列的过程。成熟的mRNA 从细胞核进入细胞质，由核糖体和其他成分阅读mRNA 所携带的信息，指导特异多肽的合成。只有mRNA 的中间序列被翻译成氨基酸。在mRNA 5′和3′端的非翻译区（5′‐UTR 和3′‐UTR）分别是第一和最后的外显子拷贝序列，其中包括了5′端的戴帽和3′端的加尾。

　　（1）翻译过程：多肽链的合成是在mRNA、t RNA 和核糖体协同作用下进行的。核糖体是一个r RNA‐蛋白质复合物，由60S 和40S 两个亚基组成。首先是小亚基识别mRNA5′端的“帽子”，沿着mRNA 移动到第一个AUG 起始密码子，mRNA 序列的每3个连续核苷酸组成一个密码子；然后t RNA 以共价键携带相应编码的氨基酸，其反密码子以碱基配对的方式结合于mRNA；最后大亚基结合小亚基，开始了肽链的合成。核糖体沿着mRNA 5′→3′移动，在肽基转移酶作用下，氨基酸不断增加，肽链延长，一直到终止密码子出现（UAA、UAG 和UGA），就不再有任何氨酰t RNA 接上去，多肽链的合成就进入终止阶段。在释放因子的作用下，肽酰t RNA 的酯键分开，于是完整的多肽链和核糖体的大亚基便释放出来，然后小亚基也脱离mRNA。

　　（2）遗传密码的兼并性：每3个碱基组成一个遗传密码，核酸分子中有4 种碱基，可以组成64（43）个密码子。而氨基酸只有20 种，每个氨基酸平均有3个密码子编码；只有蛋氨酸和色氨酸分别有一个密码子编码，而精氨酸、亮氨酸和丝氨酸分别有6个密码子编码，这种不同密码子编码同一氨基酸的特性为遗传密码的兼并性。mRNA 的密码子有64个，而细胞质t RNA 的反密码子有30个，线粒体t RNA 的反密码子有22个，但是在翻译过程中t RNA 仍然有效地运送氨基酸。关于密码子和反密码子的互补配对有一个摇摆假说，即第一和第二个碱基遵循A‐U 和G‐C 规律，第三碱基可以发生“摇摆”出现 G‐U 配对。

　　（3）翻译后加工：初始翻译产物需要进一步加工修饰，才能成为有一定生物活性的蛋白质，翻译后修饰主要是氨基酸的羟基化或磷酸化等简单的化学修饰，或是在肽链上加不同的糖基团或酯基团。从细胞分泌或输送到溶酶体、高尔基体、浆膜的蛋白都要糖基化，即在氨基酸侧链附着寡糖成为糖蛋白。一些膜蛋白上的酯酰基团起膜固定作用。许多初始翻译产物要经过氨基酸序列的剪切成为有活性的产物，如血浆蛋白、多肽激素、神经多肽、生长因子等。所有分泌型多肽都是先合成蛋白质前体，其N 末端的信号序列引导蛋白质前体定位于膜上，然后信号肽被切除。还有一些蛋白质含有其他的信号序列，例如转录因子、DNA 聚合酶、RNA 聚合酶的细胞核定位信号，使蛋白质从细胞质进入细胞核，发挥生物学活性。