报告病例中，上海8例，死亡4例；江苏6例；安徽1例；浙江3例，死亡2例。确诊病例间未发现流行病学联系，所有病例密切接触者均已采取医学观察措施，未发现异常情况。
6日上午，国家卫生计生委组织召开人感染H7N9禽流感疫情联防联控工作机制会议，通报了疫情情况、专家组意见和防控工作进展，听取了各成员单位工作报告，就加强疫情溯源、强化疫情监测、做好病例救治、主动公开信息等工作进行了研究。此外，卫生计生委选派了中西医临床专家赴疫情发生地指导临床救治工作，对医疗机构发热门诊、疫情报告、消毒等防控工作进行监督检查，并启动向世界卫生组织流感参比和研究合作中心分让毒株的程序。
上海市商务委员会6日会同各有关部门和区县采取行动，确保上海三大活禽批发市场和461家活禽定点零售点暂时停止活禽交易。目前，3家定点活禽批发市场已全部暂时停止活禽交易活动，并进行了清理、消毒、封闭处理。据对全市17个区县联系确认，全市461家活禽定点零售点已于4月6日开始全部暂时停止活禽交易活动。截至6日，已取缔各类马路市场活禽交易点84个，取缔无照经营户1户，责令改正18户，查获活水禽486只，查获野生鸟类9只，接受消费者投诉举报2件。南京市决定从4月6日起在全市范围内暂停活禽交易，关闭所有活禽交易市场，要求11个行政区对各区情况实行每日一报。截至目前，南京市停止销售、被控制的活禽共计有8408只，其中鸡5105只、鸭2928只、鹅165只、鸽子210只。
杭州市疾控中心5日从该市上城区滨盛农副产品商行活禽摊点的12份鸽子羽毛及足涂抹物、禽类粪便、笼具及操作台涂抹物以及褪毛污水的样本中检出5份样本含有H7N9禽流感病毒核酸。6日2时起，杭州市有关部门迅速组织力量，对滨盛农副产品商行内放存的活禽进行扑杀，并暂停该商行内的活禽交易。
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