从依照标准学科划分可分为：法医毒理学、临床毒理学、管理毒理学或法规毒理学、研究毒理学等。

　　从应用毒理学可分为：食品毒理学、工业毒理学、农药毒理学、军事毒理学、放射毒理学、环境毒理学、生态毒理学等分支。

　　从研究对象可分为：昆虫毒理学、兽医毒理学、人体毒理学和植物毒理学。

　　从研究领域可分为：药物毒理学、环境毒理学、食品毒理学、工业毒理学、临床毒理学、法医毒理学、分析毒理学、军事毒理学、管理毒理学等。

　　从研究的靶器官或系统可分为：器官毒理学、肝脏毒理学、肾脏毒理学、眼毒理学、耳毒理学、神经毒理学、生殖毒理学、免疫毒理学、皮肤毒理学、血液毒理学等。

　　从机制研究可分为：细胞毒理学、遗传毒理学、膜毒理学、生化毒理学、分子毒理学。

　　从毒物作用时相或过程可分为：毒代动力学和毒效动力学。