（一）加强支持疗法

　　注射丙种球蛋白、转移因子、胸腺素、I L‐2等，以加强机体的免疫功能。

　　（二）原发病的治疗

　　这是菌群失调治疗的重要环节，必须去除这些原因后，再扶持正常菌群，方可奏效。如巨结肠、胆囊炎、维生素缺乏、肠道蠕动异常等。

　　（三）调整菌群的治疗

　　1﹒饮食调整 发酵性腹泻应限制糖类食物，腐败性腹泻应限制高蛋白质饮食。

　　2﹒抗菌药物 停用广谱抗生素，必要时可应用口服肠道不吸收的抗生素，来调整肠道的菌群失调，如口服新霉素、庆大霉素、万古霉素等。

　　3﹒活菌制剂 目前常用的活菌制剂有：多种乳杆菌、粪链球菌、非致病性大肠埃希菌、肠球菌、枯草杆菌、双歧杆菌、地衣芽胞杆菌等。

　　4﹒菌群促进制剂 如乳糖可扶植大肠埃希菌，叶酸可扶植肠球菌，分叉杆菌因子可扶植乳杆菌等。

　　5﹒耐药性肠球菌制剂 可耐受多种抗生素，能阻止其他菌群异常繁殖，克服菌群失调。

　　6﹒中医中药。