急性肠系膜动脉血栓形成引起的急性肠缺血比较少见，约占急性肠缺血的5%～15%。血栓形成在肠系膜上动脉的近段，几乎都是发生于有病变的节段，如动脉粥样硬化、动脉内膜炎、结节性动脉周围炎、肌纤维增生等，但以动脉粥样硬化最常见，常因腹主动脉硬化延伸至肠系膜上动脉近段2～3cm处引起的局部狭窄。此时引起的闭塞发生于肠系膜上动脉的近端，缺血范围常比较广泛，从空肠起始段到横结肠脾曲均可发生缺血坏死。如果腹腔动脉和肠系膜下动脉已有闭塞，将出现从贲门到直肠的缺血。