婴儿时期，胸腺咽管囊肿都位于颈侧部、胸锁乳突肌的前方或深面，颈部中1／3 处，为球形、无痛的肿物。囊肿的大小不定，体积很大的可扩展至对侧，并阻碍呼吸或吞咽。在青春期，囊肿常自行溃破而形成瘘管。瘘管外口都位于胸锁乳突肌的前缘。瘘管靠近颈部大血管上行，长短不等；长者可经颈内和颈外动脉之间（颈总动脉分叉处），在二腹肌深面上行，开口于腭扁桃体附近。此处的瘘管内口不易发现。瘘管狭窄弯曲，不易用探针探测；瘘管造影可确定其行径和长度。瘘管的分泌物颇似唾液；如果分泌不多，瘘管外口可暂愈合，但不久又自行溃破。囊肿和瘘管壁覆有柱状或鳞状上皮，含淋巴结样组织。

　　有效的疗法是将囊肿或瘘管全部切除。手术时注入亚甲蓝溶液，可指引切除瘘管的方向和范围。在囊肿或瘘口部作一横切口，切开浅筋膜和颈阔肌，沿胸锁乳突肌前缘向上分离，至颈总动脉分叉处以上。沿瘘管向咽壁分离，注意勿损伤颈内外动脉、静脉及舌下、迷走神经。当分离至咽壁时，由麻醉师以右手示指伸入咽部，顶起患侧扁桃体窝，术者触及指尖后，可了解分离的深度和方向，在靠近咽壁处切断瘘管，残端消毒，逐层缝合颈部组织。