患儿要对分流手术有一定的适应过程。手术后早期，每当患儿坐立等体位变动时，会引起脑脊液的急速排出，易出现眩晕、恶心、呕吐等脑缺血现象。严重者可发生桥静脉撕裂、出血，形成硬脑膜下血肿等并发症，故分流手术后的活动应逐渐开始。

　　分流手术后经过一段时间，可出现分流导管的阻塞，在脑室端多为脉络丛覆盖于管口或腹腔端管孔为大网膜、肠管等所包裹。如送入静脉系统者，则易被形成的血栓堵塞。导管堵塞后，又出现颅内压力增高者，应更换导管。也有一些病例，因较长时间的有效分流，脑脊液的分泌和吸收已形成了新的平衡状态，导管虽已阻塞，也不再出现颅内压力增高现象，出现自然治愈状态。这样则可观察其经过，暂不考虑更换或取出导管问题。

　　先天性脑积水经过分流手术，虽可缓解症状，可以较长期地生存，但仍有部分患儿生存质量不够理想，智能的发育不如常人，如伴有中枢神经的其他畸形者，则预后更差。但也有少数患儿，术前脑功能障碍较轻，术后智能可达到完全正常状态。