（一）皮肤黏膜的完整性受损
　　创伤、烧伤、各种导管放置、心瓣膜置换术等皆可引起局部防御屏障损害，导致其邻近部位寄殖病原微生物（如寄殖于皮肤的葡萄球菌属）或医院内耐药菌（如铜绿假单胞菌、大肠埃希菌、肠杆菌属、肠球菌属和不动杆菌属等）入侵形成感染。
　　
　　（二）吞噬作用受损
　
　　由中性粒细胞缺乏或减少及吞噬细胞功能障碍（包括趋化性障碍、吞噬作用减弱和杀菌活性低）所致。中性粒细胞减少症见于再生障碍性贫血、血液系统恶性疾病和肿瘤化疗后等；中性粒细胞功能不良见于蛋白缺乏所致的营养不良、系统性红斑狼疮、糖尿病、肝硬化和接受皮质激素治疗者。吞噬作用受损患者易发生条件致病菌如铜绿假单胞菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、金葡菌、表皮葡萄球菌和有荚膜的细菌以及念珠菌、曲霉属等真菌的感染。

　　（三）细胞免疫缺陷
　　原发性细胞免疫缺陷者常在成年之前死于条件致病菌感染。临床所见多为继发性，如淋巴瘤患者、肿瘤患者接受放疗或化疗者、器官移植及应用免疫抑制剂者等，亦包括结核病、获得性免疫缺陷综合征（AIDS）等患者。细胞免疫缺陷者易发生细胞内细菌、真菌、病毒和原虫等感染。

　　1﹒细菌

　　李斯特菌属、布鲁菌属、军团菌属、结核分枝杆菌、鸟型分枝杆菌、麻风杆菌和星形奴卡菌等。
　
　　2﹒真菌
　　
　　念珠菌属最常见；近年来曲霉感染也在增加，以烟曲霉为主；隐球菌属也是淋巴瘤、AIDS 等患者的重要致病菌。

　　3﹒病毒

　　单纯疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒和乙型、丙型肝炎病毒等。

　　4﹒寄生虫
   
　　肺孢菌（近据报道肺孢菌应属于真菌）病在AIDS 患者中有较高的发病率和病死率，也可发生于器官移植或急性淋巴细胞白血病接受大剂量激素维持治疗者。弓形体长期以来被认为是免疫缺陷者感染的常见病原体，亦可发生于AIDS 患者。粪类圆线虫播散型自身感染可并发于恶性肿瘤、麻风、结核等疾病或接受免疫抑制药物者。此外，尚有表现为腹泻的隐孢子虫病，以及贾第虫、溶组织阿米巴原虫等原虫感染，皆可见于AIDS 患者。

　　（四）体液免疫缺陷

　　主要为免疫球蛋白和补体缺乏，后者多为先天性。体液免疫缺陷者对有荚膜的细菌抵抗力减弱，缺乏产生炎症的调理素作用，或Ig M 形成减少，因而易发生肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、脑膜炎奈瑟球菌等感染以及某些病毒感染。

　　（五）肿瘤引致空腔器官阻塞

　　例如淋巴瘤患者可有腹腔淋巴结肿大引起胆管梗阻和胆管感染，支气管肺癌引起支气管腔阻塞和肺炎，前列腺癌可引起尿路阻塞和尿路感染。

　　 各种不同类型免疫缺陷患者发生感染时的常见病原微生物。

　　临床实际情况往往更为复杂，在同一免疫缺陷患者身上往往存在多种因素，例如人工器官移植使细胞免疫功能减低，但同时应用的大量免疫抑制药往往引起粒细胞减低，因而患者对感染更加易感。