2013年临床助理医师考试专业综合大纲大方向与2013年执业医师考试大纲基本一致，呼吸系统删除了肺动脉高压，新增了胸腔积液；循环系统：心力衰竭中新增了概述，原发性高血压中新增特殊人群的降压问题、冠心病中新增血脂紊乱的分类、诊断及治疗；消化系统删除了腹部损伤中的小肠和结肠损伤，新增了胃食管反流病、门脉高压症中加了病因和发病机制，腹外疝的概述；泌尿系统新增了肾小球疾病概述、前列腺炎；女性生殖系统中增加了宫颈炎；代谢、内分泌疾病中新增了痛风、并把原其他章节中的水电解质代谢和酸碱平衡失调移到本章。
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